在一項(xiàng)新的研究中,來自瑞士蘇黎世大學(xué)(UZH)的研究人員開發(fā)出一種分析細(xì)胞及其組分的新方法,即迭代間接免疫熒光成像(iterative indirect immunofluorescence imaging, 4i)。這種創(chuàng)新性的方法極大地改進(jìn)了生物醫(yī)學(xué)中使用的標(biāo)準(zhǔn)免疫熒光成像技術(shù),并為臨床醫(yī)生提供來自每個(gè)樣本的大量數(shù)據(jù)。4i使得在從組織到細(xì)胞器的不同水平下同時(shí)觀察至少40種蛋白及其修飾在數(shù)十萬個(gè)細(xì)胞中的同一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的空間分布成為可能。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年8月3日的Science期刊上,論文標(biāo)題為“Multiplexed protein maps link subcellular organization to cellular states”。
為了充分利用4i數(shù)據(jù),Gut開發(fā)出一種新的用于可視化觀察和分析的計(jì)算機(jī)程序,即多重蛋白圖譜(multiplexed protein map)。它從數(shù)百萬個(gè)像素中提取出多重?zé)晒庑盘?hào),并產(chǎn)生細(xì)胞中抽象但有代表性的多重蛋白分布圖譜。
在自然條件下,細(xì)菌形成混合的相互作用的群落。理解這些群落如何形成和保持穩(wěn)定在各種環(huán)境(從生物技術(shù)應(yīng)用到我們的腸道)中都很重要。Joshua E. Goldford等人從含有數(shù)百至數(shù)千個(gè)序列變體的土壤和植物中采集微生物群落。在低濃度的單一碳源培養(yǎng)后,這些微生物能夠傳代,并與彼此的代謝產(chǎn)物進(jìn)行交叉培養(yǎng);隨后,利用16S rRNA對(duì)獲得的微生物群落進(jìn)行測(cè)序,并且對(duì)這些結(jié)果進(jìn)行數(shù)學(xué)建模。在穩(wěn)定的條件下存活下來的微生物物種混合物可重復(fù)地聚集以反映實(shí)驗(yàn)實(shí)施的條件而不是初接種的微生物物種混合物。